RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PS29	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MAN1A2	O60476	641 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6AP2	O75787	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OR2J2	O76002	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NEURL1	O76050	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CLPS	P04118	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CT62	P0C5K7	136 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF7	P61962	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PIGG	Q5H8A4	983 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241		A8MVJ9	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HRK	O00198	91 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PLOD2	O00469	737 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A12	O75746	678 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SSTR4	P31391	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TAGAP	Q8N103	731 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	LIX1	Q8N485	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SVIL	O95425	2214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241		J3QKU1	62 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	ACOX3	O15254	700 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	PDPK1	O15530	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NME2P1	O60361	137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	COQ9	O75208	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TGDS	O95455	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CBX7	O95931	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SP1	P08047	785 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	LBP	P18428	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NME2	P22392	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SOX18	P35713	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN8	P56748	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	NRG3	P56975	720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP2	Q05923	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	MLC1	Q15049	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPA-222	ENST00000445241	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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