RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 TAC3Q9UHF0 121 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MYH1P12882 1939 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MYH4Q9Y623 1939 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 B4E171 279 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM150CB9EJG8 249 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PIAS2O75928 621 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PRAMEF12O95522 483 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 C8GP07360 202 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SLC5A2P31639 672 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TAS2R50P59544 299 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ENPP2Q13822 863 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GRIN2CQ14957 1233 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ARL6IP1Q15041 203 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PDGFRLQ15198 375 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TM9SF2Q99805 663 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MGAT4BQ9UQ53 548 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1W2PRB8 838 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 H3BMQ9 156 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PEX12O00623 359 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 OPN1LWP04000 364 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ACVRL1P37023 503 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GDF5P43026 501 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CCR8P51685 355 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GAB3Q8WWW8 586 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 FZD4Q9ULV1 537 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 RNF6Q9Y252 685 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MT-CO2P00403 227 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TNFP01375 233 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CD1DP15813 335 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 OR4D2P58180 307 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 EIPR1Q53HC9 387 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 LCN8Q6JVE9 175 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 DTX3Q8N9I9 347 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TM9SF4Q92544 642 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 BRF2Q9HAW0 419 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 RHCGQ9UBD6 479 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.1□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ST8SIA5O15466 376 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TGOLN2O43493 480 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ENGP17813 658 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HTR1EP28566 365 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GABREP78334 506 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CARD17Q5XLA6 110 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MZB1Q8WU39 189 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MYRFLQ96LU7 910 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PIRO00625 290 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ITGA5P08648 1049 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HSD17B1P14061 328 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TYRP1P17643 537 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 BDKRB2P30411 391 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CDKN2CP42773 168 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SLC1A3P43003 542 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF616Q08AN1 781 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 NPWQ8N729 165 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MR1Q95460 341 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TXN2Q99757 166 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 OR51B5Q9H339 312 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 DKKL1Q9UK85 242 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PDCD5O14737 125 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HCKP08631 526 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 KCNE1P15382 129 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 CD1BP29016 333 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEB1P43366 347 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 GSK3AP49840 483 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 RORCP51449 518 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 HSDL2Q6YN16 418 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 LGI4Q8N135 537 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 SCML4Q8N228 414 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 TSGA13Q96PP4 275 aa11.09□□□□□ -0.63
CCBE1-202ENST00000439986 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms