RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 GTDC1Q4AE62 458 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ISCA2Q86U28 154 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 FAM217AQ8IXS0 508 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 TSPEARQ8WU66 669 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PCTPQ9UKL6 214 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 POU3F4P49335 361 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CTBP2P56545 445 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CLCA4Q14CN2 919 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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PTPRF-209ENST00000438120 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 OXTRP30559 389 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RPA4Q13156 261 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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PTPRF-209ENST00000438120 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 GGT2P36268 569 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 NPRL3Q12980 569 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RAB33AQ14088 237 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 I3L521 148 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RHCEP18577 417 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RAB28P51157 221 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CLDN8P56748 225 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PITX2Q99697 317 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 MAN2B1O00754 1011 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 GSTT2P0CG29 244 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 LCN1P31025 176 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 VEGFBP49765 207 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 GPR83Q9NYM4 423 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RAD51DO75771 328 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RGS19P49795 217 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 FAM3CQ92520 227 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 STRA6Q9BX79 667 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF35P13682 527 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 DRD2P14416 443 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.219e-7■■□□□ 11.9
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC26A5P58743 744 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 MAP4K2Q12851 820 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CDNFQ49AH0 187 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 C3orf33Q6P1S2 294 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 IGFN1Q86VF2 1251 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ELP5Q8TE02 316 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SCRN2Q96FV2 425 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SLC19A2O60779 497 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CNMDO75829 334 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CTSAP10619 480 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PTGER1P34995 402 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 STEAP4Q687X5 459 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 LEG1Q6P5S2 330 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.36■□□□□ 0.21
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PTPRF-209ENST00000438120 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SCD5Q86SK9 330 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 PPM1BO75688 479 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CERS1P27544 350 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRF-209ENST00000438120 CLDN2P57739 230 aa16.35■□□□□ 0.21
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