RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436927.5

NVL-204, Transcript of nuclear VCP-like, human

TSL 3

Gene NVL, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NVL-204	ENST00000436927	POLB	P06746	335 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	APRT	P07741	180 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	FGF2	P09038	288 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SPTB	P11277	2137 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MLN	P12872	115 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MSH3	P20585	1137 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CD9	P21926	228 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MCM3	P25205	808 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	FDFT1	P37268	417 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	HADHA	P40939	763 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	LMAN1	P49257	510 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	RAB28	P51157	221 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PGGT1B	P53609	377 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	GSDMD	P57764	484 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CDK16	Q00536	496 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PDE1B	Q01064	536 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ANK2	Q01484	3957 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	GUCY2D	Q02846	1103 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	FOXO1	Q12778	655 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	KIF5A	Q12840	1032 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PRKG2	Q13237	762 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	BRD3	Q15059	726 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	NCF4	Q15080	339 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	IGFBP7	Q16270	282 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PFKFB4	Q16877	469 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MANEA	Q5SRI9	462 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CES3	Q6UWW8	571 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	FAM57B	Q71RH2	274 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	GALNT7	Q86SF2	657 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PAQR7	Q86WK9	346 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	KRT222	Q8N1A0	295 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SPC24	Q8NBT2	197 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ACBD4	Q8NC06	268 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR2L3	Q8NG85	312 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR4L1	Q8NH43	312 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CD200R1	Q8TD46	325 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	LCN9	Q8WX39	176 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CATSPER2	Q96P56	530 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SERPINB12	Q96P63	405 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	IL17F	Q96PD4	163 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OR4K3	Q96R72	315 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	HGH1	Q9BTY7	390 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CRB3	Q9BUF7	120 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	NUDT9	Q9BW91	350 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	TRIM2	Q9C040	744 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	IL22	Q9GZX6	179 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	EURL	Q9NYK6	297 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PAK5	Q9P286	719 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PADI1	Q9ULC6	663 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	PSAT1	Q9Y617	370 aa		2.55	□□□□□ -2
NVL-204	ENST00000436927	ZAN	Q9Y493	2812 aa		2.55	□□□□□ -2

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