RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.66□□□□□ -1.02
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.65□□□□□ -1.02
CDC42-IT1-201ENST00000431803 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.65□□□□□ -1.02
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.65□□□□□ -1.02
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q9UFV3 132 aa8.65□□□□□ -1.02
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCTPQ9UKL6 214 aa8.64□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.64□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.64□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.64□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VPS13CQ709C8 3753 aa8.63□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.63□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.63□□□□□ -1.03
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBP1P09455 135 aa8.63□□□□□ -1.03
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