RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 ARHGEF9O43307 516 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 KCNAB3O43448 404 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PEX11AO75192 247 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PCNAP12004 261 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CXCR2P25025 360 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 GSTM2P28161 218 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 KIR2DL3P43628 341 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ARSFP54793 590 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 RELAQ04206 551 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SQLEQ14534 574 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 NAA25Q14CX7 972 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SPINK14Q6IE38 97 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PLD3Q8IV08 490 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 BEST3Q8N1M1 668 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 C1orf50Q9BV19 199 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MS4A8Q9BY19 250 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 C1orf109Q9NX04 203 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CR1P17927 2039 aa9.38□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 FREM3P0C091 2139 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GTH9 108 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ERICH4A6NGS2 130 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD28O15084 1053 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MAN1A2O60476 641 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CTSVO60911 334 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC3AO75596 197 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SEMA3DO95025 777 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 IFNA2P01563 188 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 IDO1P14902 403 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 AHRP35869 848 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 CD96P40200 585 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 EFNA3P52797 238 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 DIO3P55073 304 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PHEXP78562 749 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 EMX2Q04743 252 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PMPCAQ10713 525 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 HYAL2Q12891 473 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 KLF10Q13118 480 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TUBA3CQ13748 450 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 KRT72Q14CN4 511 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 GSTA3Q16772 222 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 IMPG1Q17R60 797 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ADCK2Q7Z695 626 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 P3H2Q8IVL5 708 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TTLQ8NG68 377 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 MIEF2Q96C03 454 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 APIPQ96GX9 242 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 BDH2Q9BUT1 245 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 AICDAQ9GZX7 198 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 DSCAMO60469 2012 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 NCKAP5O14513 1909 aa9.37□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.36□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM64BA6NI03 449 aa9.36□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 A8MUI8 341 aa9.36□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 C4orf51C9J302 202 aa9.36□□□□□ -0.91
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFS4O43181 175 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms