RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 GBAP04062 536 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POU2F1P14859 743 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB10P48595 397 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCYT1AP49585 367 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZP1P60852 638 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR19Q15760 415 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNJQ5T5M9 372 aa3.42□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL15Q96M94 604 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP28Q9H239 520 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.42□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 DRD2P14416 443 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A5P22732 501 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 SDE2Q6IQ49 451 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 CEP44Q9C0F1 390 aa3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH10Q9P2E7 1040 aa3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PI62 339 aa3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.868e-7■■■■■ 32.7
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PGGT1B-203ENST00000419445 CKMT1AP12532 417 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA4P29622 427 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN20P56880 219 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NOXA1Q86UR1 476 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.41□□□□□ -1.86
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