RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 HPS4Q9NQG7 708 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MED17Q9NVC6 651 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 NECAP2Q9NVZ3 263 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 IMPAD1Q9NX62 359 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAJB9Q9UBS3 223 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MLXQ9UH92 298 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 NRBP1Q9UHY1 535 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ITM2BQ9Y287 266 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCL27Q9Y4X3 112 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR1A2Q9Y585 309 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACEP12821 1306 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLIT3O75094 1523 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 HTR3EA5X5Y0 456 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRABD2BA6NFA1 517 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANKDD1BA6NHY2 528 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC69A6NI79 296 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNF212BA8MTL3 300 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERPINE3A8MV23 424 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 NPIPA3F8WFD2 350 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 H0YIG0 161 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 M0R296 226 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TTI1O43156 1089 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSMD3O43242 534 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RTN2O75298 545 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GRAP2O75791 330 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERF1AO75920 110 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR6A2O95222 327 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GAS8O95995 478 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GH1P01241 217 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 HMOX1P09601 288 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC166P0CW27 439 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TPBGLP0DKB5 382 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GLULP15104 373 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF823P16415 610 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ADRA2CP18825 462 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACKR3P25106 362 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CALML3P27482 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CTNNB1P35222 781 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR3A4PP47883 348 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 FHITP49789 147 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CAV2P51636 162 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ARHGDIAP52565 204 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCNK10P57789 538 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PFN3P60673 137 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPL27P61353 136 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPP38P78345 283 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC3A1Q07837 685 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CD47Q08722 323 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CETN1Q12798 172 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CEACAM7Q14002 265 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 HEPACAMQ14CZ8 416 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PPA1Q15181 289 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPS6KA1Q15418 735 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TRADDQ15628 312 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 UGCGQ16739 394 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 KYAT1Q16773 422 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MICAQ29983 383 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF674Q2M3X9 581 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 QRICH1Q2TAL8 776 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACER2Q5QJU3 275 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TATDN1Q6P1N9 297 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM270Q6UE05 265 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 IL34Q6ZMJ4 242 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GBP6Q6ZN66 633 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 Q6ZRG5 221 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCTD9Q7L273 389 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 OTOAQ7RTW8 1153 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ASPGQ86U10 573 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANKRD46Q86W74 232 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 IQCA1Q86XH1 822 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CACUL1Q86Y37 369 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 LYPD1Q8N2G4 141 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ELMOD1Q8N336 334 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 LINC01555Q8NAE3 123 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms