RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 WACQ9BTA9 647 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CHD4Q14839 1912 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NUAK1O60285 661 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 H2BFMP0C1H6 154 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 BMP2P12643 396 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ARSAP15289 507 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ARPC4P59998 168 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GABARAPL2P60520 117 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 IER5LQ5T953 404 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PEX11GQ96HA9 241 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TIGARQ9NQ88 270 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NANSQ9NR45 359 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 OR2AT4A6NND4 320 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRN3E7EW58 273 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SOCS7O14512 581 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SPHARQ15513 63 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SERINC2Q96SA4 455 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HBQ1P09105 142 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CKMT1AP12532 417 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX2P48431 317 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SERTAD2Q14140 314 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 RGNQ15493 299 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LPAR4Q99677 370 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NTMT1Q9BV86 223 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PLD2O14939 933 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDT1P36639 197 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CCINQ13939 588 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ASRGL1Q7L266 308 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GALNT10Q86SR1 603 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LRR1Q96L50 414 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 10.1
SH3BP4-203ENST00000409212 CD207Q9UJ71 328 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HCN2Q9UL51 889 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 DISC1C4P0D8 188 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 LATO43561 262 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 S100A6P06703 90 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 YES1P07947 543 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 VAMP1P23763 118 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PDHA2P29803 388 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC39A13Q96H72 371 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 FRMD6Q96NE9 622 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF69Q9UC07 566 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NENFQ9UMX5 172 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTT2P0CG29 244 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 DPP6P42658 865 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 MAB21L1Q13394 359 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CBFBQ13951 182 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 EDIL3O43854 480 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKCAP17252 672 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CCNOP22674 350 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ACTA2P62736 377 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 ACTG2P63267 376 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 VEZF1Q14119 521 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 KIR2DS3Q14952 304 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 NSDHLQ15738 373 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PMM1Q92871 262 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 SH3D21A4FU49 640 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAMEF2O60811 474 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-203ENST00000409212 JRKO75564 520 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms