RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 RSC1A1Q92681 617 aa3.75□□□□□ -1.81
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LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF347Q96SE7 839 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FEVQ99581 238 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EPYCQ99645 322 aa3.75□□□□□ -1.81
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LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.74□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 POU2F1P14859 743 aa3.74□□□□□ -1.81
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LRRTM4-201ENST00000409088 CDH3P22223 829 aa3.74□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CD27P26842 260 aa3.74□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
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