RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371146.5

USP1-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP1, Length 3,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-202ENST00000371146 POMT2Q9UKY4 750 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SEC14L5O43304 696 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SCN2BO60939 215 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RFPL1O75677 317 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR89BP0CG08 455 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GIMD1P0DJR0 217 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 F8A1P23610 371 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR3P46089 330 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PER3P56645 1201 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 BCL7AQ4VC05 210 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SFT2D3Q587I9 215 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TCTE1Q5JU00 501 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DIO2Q92813 273 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RGMAQ96B86 450 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GHITMQ9H3K2 345 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 POLE3Q9NRF9 147 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 POLHQ9Y253 713 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C9orf172C9J069 976 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GMNNO75496 209 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CAPNS1P04632 268 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CRATP43155 626 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LCN10Q6JVE6 187 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SYVN1Q86TM6 617 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RAB8BQ92930 207 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OTULINQ96BN8 352 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PPCDCQ96CD2 204 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR4K3Q96R72 315 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PIP5K1AQ99755 562 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR83Q9NYM4 423 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ADA2Q9NZK5 511 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ACANP16112 2415 aa6.63□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TSC2P49815 1807 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 A0A1B0GWJ7 208 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SH3D21A4FU49 640 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C17orf105B2RV13 164 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C5orf58C9J3I9 102 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TM4SF5O14894 197 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RGS14O43566 566 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CLN5O75503 358 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SNX4O95219 450 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ALPPP05187 535 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 IL3P08700 152 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OCM2P0CE71 109 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PRKCAP17252 672 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ARSFP54793 590 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPAT3Q53EU6 434 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ARTNQ5T4W7 220 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.62□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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