RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB3CQ96E17 227 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 DTD2Q96FN9 168 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ACCSQ96QU6 501 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCG4Q9H172 646 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 AMBNQ9NP70 447 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CUTCQ9NTM9 273 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR34Q9NV39 138 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF24Q9Y225 148 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQ72 361 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 THY1P04216 161 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 APRTP07741 180 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 P4HA1P13674 534 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 UCP1P25874 307 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGCLP35914 325 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NAAAQ02083 359 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 VITQ6UXI7 678 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RAPH1Q70E73 1250 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SERINC5Q86VE9 423 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL16Q8N461 479 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL14Q8N4G2 192 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2ACQ93077 130 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA13Q96N96 652 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RANBP9Q96S59 729 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V0BQ99437 205 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRL4Q9HBW9 690 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NRN1Q9NPD7 142 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CIDEBQ9UHD4 219 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 APPL1Q9UKG1 709 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 EMCNQ9ULC0 261 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNJ2O15056 1496 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CYB561D2O14569 222 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 LRP3O75074 770 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 GOT2P00505 430 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD2P08910 425 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DPA1P20036 260 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NOVP48745 357 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A2P52569 658 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 IST1P53990 364 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 MFAP2P55001 183 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CBX3Q13185 183 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 RUNX3Q13761 415 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF3Q5VWG9 929 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 APOOLQ6UXV4 268 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 BNIPLQ7Z465 357 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 LUZP1Q86V48 1076 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 NAXDQ8IW45 347 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 HSCBQ8IWL3 235 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM9BQ8IZU0 186 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 GPD1LQ8N335 351 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TBCKQ8TEA7 893 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V0A1Q93050 837 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 BIRC7Q96CA5 298 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CPXM1Q96SM3 734 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ACAT2Q9BWD1 397 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR174Q9BXC1 333 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 CARD9Q9H257 536 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ENTPD4Q9Y227 616 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms