RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 GLRA3O75311 464 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KRT34O76011 436 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PGM3O95394 542 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 TNNC2P02585 160 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 CDHR1Q96JP9 859 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.891e-7■■■□□ 17.5
PTPRK-202ENST00000368205 OR52B2Q96RD2 323 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 CDRT15Q96T59 188 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GFI1Q99684 422 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 COL4A5P29400 1685 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 BRWD3Q6RI45 1802 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.21□□□□□ -1.89
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PTPRK-202ENST00000368205 KPNA7A9QM74 516 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HACD1B0YJ81 288 aa3.21□□□□□ -1.9
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