RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 STARD5Q9NSY2 213 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 SDC3O75056 442 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 CPMP14384 443 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 IL1RL1Q01638 556 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 CA13Q8N1Q1 262 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.2■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 OR7D2Q96RA2 312 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K3Q99759 626 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 J3KTA2 159 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PIAS2O75928 621 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ELK4P28324 431 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 MAN2A2P49641 1150 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 DMWDQ09019 674 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf28Q4W4Y0 310 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR5T3Q8NGG3 340 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 TCTN2Q96GX1 697 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 ETS2P15036 469 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 SHC2P98077 582 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 KEAP1Q14145 624 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR7G2Q8NG99 324 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 COL26A1Q96A83 441 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A4EQ96PG1 132 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 BTBD2Q9BX70 525 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ACTRT3Q9BYD9 372 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRA2Q9H9E1 313 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC88CQ9P219 2028 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH3B2P48448 385 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PRTGQ2VWP7 1150 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR10G2Q8NGC3 310 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 RYKP34925 604 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 LIMS1P48059 325 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 HMGA2P52926 109 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 RAB38P57729 211 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM92BQ6ZTR7 304 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR2L13Q8N349 312 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR52J3Q8NH60 311 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PTGFRNQ9P2B2 879 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 KCND3Q9UK17 655 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 KCNE3Q9Y6H6 103 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 SGK494L7N484 410 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 OR6B1O95007 311 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 ISL1P61371 349 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 CD47Q08722 323 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 MICAQ29983 383 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 SETD9Q8NE22 299 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 A8MVJ9 347 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXD8-201ENST00000313173 ANXA8P13928 327 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 EPHA4P54764 986 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 GPAT3Q53EU6 434 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 PSD2Q9BQI7 771 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-201ENST00000313173 GABARAPL3Q9BY60 117 aa25.16■■□□□ 1.62
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