RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ETFAP13804 333 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ART1P52961 327 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 HYLS1Q96M11 299 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD9AQ99638 391 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IGSF5Q9NSI5 407 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PCTPQ9UKL6 214 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNS2Q9ULS6 477 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FRS2Q8WU20 508 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA5P01569 189 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SGCAQ16586 387 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZD9Q8IXQ8 264 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NETO1Q8TDF5 533 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 BRF2Q9HAW0 419 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK12Q9HB15 430 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RABL2BQ9UNT1 228 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX30O94993 753 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP24386 653 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB5BP61020 215 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4C11Q6IEV9 310 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJA3Q96EY1 480 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PEAK1Q9H792 1746 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 G3V2L1 256 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSDP51689 593 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT10Q86SR1 603 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF778Q96MU6 729 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL7BQ9BQE9 202 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR9Q9NR96 1032 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MTNR1AP48039 350 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 APOFQ13790 326 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM164Q5U3C3 297 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM205Q6UW68 189 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17FQ96PD4 163 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NEDD4LQ96PU5 975 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNG6Q9BXT2 260 aa23.06■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAP00813 363 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A8Q8N695 610 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2M4Q96R27 311 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 LDAHQ9H6V9 325 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SCO2O43819 266 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DRD2P14416 443 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB3BP20337 219 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A5P58743 744 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DEDD2Q8WXF8 326 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FUOMA2VDF0 154 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BMQ9 156 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD11B2P80365 405 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM2Q14416 872 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG10BQ5I7T1 473 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CARD17Q5XLA6 110 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD11Q8NFV4 315 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 COG8Q96MW5 612 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SACM1LQ9NTJ5 587 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PLATP00750 562 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IVDP26440 423 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 LSSP48449 732 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM46BQ96A09 425 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GLS2Q9UI32 602 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ADH6P28332 368 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF18BQ86Y91 864 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TMIGD2Q96BF3 282 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.05■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FGF18O76093 207 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN3P20807 821 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NR4A2P43354 598 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAPQ12770 1279 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPEREQ5SY80 951 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPA2E9PIF3 369 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPA3F8WFD2 350 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR1C4P17516 323 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CNR2P34972 360 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RIDAP52758 137 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX26Q8N6G2 289 aa23.04■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FARS2O95363 451 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms