RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGR2AP12318 317 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PEPDP12955 493 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NAGAP17050 411 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SRD5A1P18405 259 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN6P29350 595 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB1P30740 379 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNSP34059 522 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GMPRP36959 345 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP3P42574 277 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A12P48065 614 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SQLEQ14534 574 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2A1Q16548 175 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 STK32CQ86UX6 486 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW5Q969U6 566 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SFXN2Q96NB2 322 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NDNQ99608 321 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PROK2Q9HC23 129 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 WWOXQ9NZC7 414 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 STOML1Q9UBI4 398 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TFR2Q9UP52 801 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NINQ8N4C6 2090 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PP18 115 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FRG2CA6NGY1 282 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf51C9J302 202 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01387J3KSC0 135 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SIAH2O43255 324 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF13O75888 250 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC4O95801 387 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FTCDO95954 541 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO1A2P46721 670 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP1GDS1P52306 607 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW4P57775 412 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PHEXP78562 749 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ID2Q02363 134 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 DCST1Q5T197 706 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF550Q7Z398 422 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MCUQ8NE86 351 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO6Q96DC7 493 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD4Q96DR4 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HES6Q96HZ4 224 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT9Q9BTE0 207 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10A4Q9H209 315 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 DKKL1Q9UK85 242 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 WIPF1O43516 503 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 HCRTR2O43614 444 aa7.12□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF17O60258 216 aa7.12□□□□□ -1.27
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