RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTSFQ9UBX1 484 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PISDQ9UG56 409 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPST1O60507 370 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAOAP21397 527 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NETO1Q8TDF5 533 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCLNQ969V3 563 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF145Q96MT1 663 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHID1Q9BWS9 393 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LANCL2Q9NS86 450 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.38■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FHP07954 510 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTSP30990 170 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOAT1P35610 550 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRNB3Q05901 458 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VMACQ2NL98 169 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLAHQ9NV23 265 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 V9GYQ6 96 aa22.37■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GFRA3O60609 400 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAP2AP10114 183 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RORAP35398 523 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC13A2Q13183 592 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RGNQ15493 299 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEBPEQ15744 281 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTOV1Q86YD1 416 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGED4Q96JG8 741 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSME2Q9UL46 239 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGEA13PA6NCF6 341 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B4E171 279 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 H0YJX3 145 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BMP10O95393 424 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR75O95800 540 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UQCRBP14927 111 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2R1BP30154 601 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPAN7P41732 249 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6AP1Q15904 470 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXO30Q8TB52 745 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAT2AQ92830 837 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TANKQ92844 425 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST8Q9H2A9 424 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.36■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPMP14384 443 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOX18P35713 384 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADRM1Q16186 407 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM107Q6UX40 140 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EID3Q8N140 333 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.35■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A6NHS1 94 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LDLRP01130 860 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JMJD7P0C870 316 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPC1P35052 558 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSPA13P48723 471 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VEZF1Q14119 521 aa22.34■■□□□ 1.17
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms