RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 ADRM1Q16186 407 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CYP51A1Q16850 503 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 VMACQ2NL98 169 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 VWA2Q5GFL6 755 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MTX3Q5HYI7 312 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 LCN8Q6JVE9 175 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 RNF130Q86XS8 419 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MICU2Q8IYU8 434 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 C10orf111Q8N326 155 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 NUP43Q8NFH3 380 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 OR7G2Q8NG99 324 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 RIT1Q92963 219 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PMEPA1Q969W9 287 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 SPSB2Q99619 263 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 TRIM15Q9C019 465 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GIN1Q9NXP7 522 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 AQP12BA6NM10 295 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 C9orf172C9J069 976 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 AGRPO00253 132 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ARPC2O15144 300 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 DYRK3O43781 588 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 COQ9O75208 318 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 AGR2O95994 175 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ETFAP13804 333 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GGT1P19440 569 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CD82P27701 267 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CRATP43155 626 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PRIM2P49643 509 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 KHKP50053 298 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CLDN6P56747 220 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 OR4D2P58180 307 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 FUT7Q11130 342 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 RIPK1Q13546 671 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 NSDHLQ15738 373 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 COX20Q5RI15 118 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 IFNEQ86WN2 208 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 DHFR2Q86XF0 187 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PTOV1Q86YD1 416 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 LGI4Q8N135 537 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 KAT2AQ92830 837 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GIMAP5Q96F15 307 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 ACTRT3Q9BYD9 372 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 SATB2Q9UPW6 733 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 TTC36A6NLP5 189 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 DUXAA6NLW8 204 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 IDSB3KWA1 339 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 HMGN4O00479 90 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 MGRN1O60291 552 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 GMNNO75496 209 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CBX7O95931 251 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 C1QCP02747 245 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 HEXBP07686 556 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CT62P0C5K7 136 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF3-201ENST00000292393 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms