RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF91Q05481 1191 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 MTFR2Q6P444 385 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TEX261Q6UWH6 196 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 U3KQ87 197 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 IFNW1P05000 195 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CTRB1P17538 263 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 IL1RNP18510 177 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PER3P56645 1201 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 KLHL22Q53GT1 634 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 FRG2Q64ET8 278 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TTC9Q92623 222 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CHFRQ96EP1 664 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 C12orf66Q96MD2 445 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 FRG2BQ96QU4 278 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ZBP1Q9H171 429 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SCML1Q9UN30 329 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CACNA1CQ13936 2221 aa10.29□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CD8B2A6NJW9 211 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 MPZL2O60487 215 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CD8BP10966 210 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 GPX2P18283 190 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 MESP2Q0VG99 397 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 RGNQ15493 299 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 COX20Q5RI15 118 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PARM1Q6UWI2 310 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 HMGB4Q8WW32 186 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SUSD6Q92537 303 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 REPS1Q96D71 796 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SLC32A1Q9H598 525 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 SESN1Q9Y6P5 492 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ARID1AO14497 2285 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 HYKKA2RU49 373 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 VNN2O95498 520 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ANXA3P12429 323 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 EPORP19235 508 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 DRD5P21918 477 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 EPHA5P54756 1037 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CACNG1Q06432 222 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TNK1Q13470 666 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 GCNT6Q5T4J0 391 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TPGS2Q68CL5 300 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF852Q6ZMS4 543 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 RBFAQ8N0V3 343 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 PTGFRNQ9P2B2 879 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 GPR52Q9Y2T5 361 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TNFRSF10BO14763 440 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 KDM4BO94953 1096 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CLCN4P51793 760 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CDK6Q00534 326 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 RBBP4Q09028 425 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TEAD4Q15561 434 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 AANATQ16613 207 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM65Q6PI78 240 aa10.28□□□□□ -0.76
CNGA3-201ENST00000272602 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms