RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NELL2Q99435 816 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 WRBO00258 174 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OPRL1P41146 370 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KLBQ86Z14 1044 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.76■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GPR4P46093 362 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CXCR4P61073 352 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF639Q9UID6 485 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLX4Q8IY92 1834 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ACOT8O14734 319 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DDCP20711 480 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ODF4Q2M2E3 257 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LCTLQ6UWM7 567 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 Q6ZSR9 355 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OR56A3Q8NH54 315 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 A8MU76 341 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CSN2P05814 226 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CRHBPP24387 322 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NTSR1P30989 418 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CBLL1Q75N03 491 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FOXJ1Q92949 421 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SEMA3DO95025 777 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CDK4P11802 303 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARSAP15289 507 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ITGA3P26006 1051 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CD40LGP29965 261 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PUDPQ08623 228 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ITGB7P26010 798 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SOX2P48431 317 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SELPLGQ14242 412 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KLHL26Q53HC5 615 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF480Q8WV37 535 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DTD2Q96FN9 168 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 IL21RQ9HBE5 538 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF69Q9UC07 566 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GXYLT2A0PJZ3 443 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GSTT2P0CG29 244 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TIMP2P16035 220 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CBLP22681 906 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GGT2P36268 569 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GPR143P51810 404 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 AKR1D1P51857 326 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGDIBP52566 201 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAPK14Q16539 360 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC32Q9BV29 185 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MYNNQ9NPC7 610 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LATO43561 262 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PRKYO43930 277 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HLA-FP30511 346 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FAM189A2Q15884 450 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RBP7Q96R05 134 aa16.74■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HYKKA2RU49 373 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C5orf51A6NDU8 294 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms