RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF766Q5HY98 468 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF675Q8TD23 568 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NUDT8Q8WV74 236 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ADIPOR1Q96A54 375 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TUBGCP3Q96CW5 907 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR6C76A6NM76 312 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 J3QKU1 62 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR6B1O95007 311 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 LRATO95237 230 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SP1P08047 785 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PCSK2P16519 638 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SOX3P41225 446 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SSR4P51571 173 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 IL23RQ5VWK5 629 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ATG16L1Q676U5 607 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MDGA2Q7Z553 956 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 LIX1Q8N485 282 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 C1orf50Q9BV19 199 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NUF2Q9BZD4 464 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 REEP4Q9H6H4 257 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 AKAP10O43572 662 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 EMX2Q04743 252 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FHL5Q5TD97 284 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TMEM156Q8N614 296 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GRHL3Q8TE85 626 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 KAT2AQ92830 837 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 KLHL1Q9NR64 748 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MAP10Q9P2G4 905 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TENM4Q6N022 2769 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A12O75746 678 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MPIP34949 423 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 EMDP50402 254 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R2AP63151 447 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PTGR1Q14914 329 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SMU1Q2TAY7 513 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR7G2Q8NG99 324 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ASIC5Q9NY37 505 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SDHDO14521 159 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF195O14628 629 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PLOD3O60568 738 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 WISP2O76076 250 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PRPS2P11908 318 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CD46P15529 392 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GPX3P22352 226 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ASMTP46597 345 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ASB15Q8WXK1 588 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TP53INP1Q96A56 240 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 BBS4Q96RK4 519 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ASPDHA6ND91 283 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NME2P1O60361 137 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.4 ms