RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Srd5a3Q9WUP4 330 aa14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cpne6Q9Z140 557 aa14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rhox2dW4VSN9 191 aa14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trav1A0A075B5Z4 110 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm14399A2ARW8 610 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r18E9Q280 788 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxw9F8VPX2 458 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm5152L7N200 190 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 B3galt2O54905 422 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PahP16331 453 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpx5P21765 221 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klrb1aP27811 227 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tm9sf2P58021 662 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 H2-Q6P79568 326 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gbx1P82976 418 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FhP97807 507 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Coq10bQ3THF9 240 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ankrd37Q569N2 159 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 B3gnt3Q5JCS9 372 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1133Q7TR44 313 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr814Q7TRH4 310 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ston1Q8CDJ8 730 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spns1Q8R0G7 528 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Syngr3Q8R191 229 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ing3Q8VEK6 421 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr514Q8VFZ6 310 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rfpl4aQ8VH31 287 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem63aQ91YT8 804 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Natd1Q9DBW3 110 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fer1l4A3KGK3 1992 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Greb1Q3UHK3 1954 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pramef20B1ARV6 477 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr310B2RVZ1 332 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il20rbE9Q9A6 308 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 5830473C10RikF8VQ07 620 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp275G3X904 499 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Aff2O55112 1272 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gabrg3P27681 467 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ido1P28776 407 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CtgfP29268 348 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fgf17P63075 216 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cct3P80318 545 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nell1Q2VWQ2 810 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc28Q3TX51 367 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TfptQ3U1J1 259 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Yipf3Q3UDR8 347 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 C1orf109Q499E6 217 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Defb46Q4QY34 57 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4930512M02RikQ5SQK8 218 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nqo1Q64669 274 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trim46Q7TNM2 759 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q810M1 233 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Snx16Q8C080 344 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Iglon5Q8HW98 336 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fmo2Q8K2I3 535 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ManbaQ8K2I4 879 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tceal3Q8R0A5 200 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ubqln1Q8R317 582 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1033Q8VFK5 310 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mgat2Q921V5 442 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tada1Q99LM9 335 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Adck1Q9D0L4 525 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ppa1Q9D819 289 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prss52Q9D9M0 321 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Smpd3Q9JJY3 655 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ap3m1Q9JKC8 418 aa14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AgmatA2AS89 358 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kctd17E0CYQ0 296 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm8897L7N294 181 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r45L7N2B5 852 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 P01657 111 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CryabP23927 175 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TtlP38585 377 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 EpxP49290 716 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Yy2Q3TTC2 378 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc160Q3UYG1 323 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grm7Q68ED2 915 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prss54Q7M756 383 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Otub1Q7TQI3 271 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1307Q7TQX1 312 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ttc23Q8CHY7 488 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tm6sf2Q8R1J1 378 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr114Q923Q8 312 aa14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MlycdQ99J39 492 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70 ms