RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 POM121Q96HA1 1249 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF597Q96LX8 424 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SH3GL2Q99962 352 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR8Q9H981 624 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 NAV3Q8IVL0 2385 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 DVL2O14641 736 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 EPPINO95925 133 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35E2P0CK97 266 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 BMP5P22003 454 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PHEXP78562 749 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SETDB1Q15047 1291 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM198Q66K66 360 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM64Q6YI46 380 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 DIO2Q92813 273 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TP53INP1Q96A56 240 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 REPS1Q96D71 796 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TIMP4Q99727 224 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ACOT9Q9Y305 439 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN14A8MX76 684 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TP53I11O14683 189 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RAD51CO43502 376 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 UGDHO60701 494 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TIMP3P35625 211 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ASCL1P50553 236 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KA2Q15349 733 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FBF1Q8TES7 1133 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 UCN3Q969E3 161 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 WDR41Q9HAD4 459 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC189A1A4V9 331 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 AIFM1O95831 613 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SSTR4P31391 388 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 STX2P32856 288 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW4P57775 412 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PFKFB4Q16877 469 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FLYWCH1Q4VC44 716 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 BICRALQ6AI39 1079 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 LACC1Q8IV20 430 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FAM222BQ8WU58 562 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC46Q96FV0 321 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 UBQLN3Q9H347 655 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SNX15Q9NRS6 342 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PS29 197 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 A6NNC1 897 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PGRMC2O15173 223 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC6AO75865 159 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SNX4O95219 450 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 HPNP05981 417 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 GFAPP14136 432 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA4P43358 317 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PLTPP55058 493 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 WNT3P56703 355 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 IRF9Q00978 393 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 NAB1Q13506 487 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CEBPEQ15744 281 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC7Q5VTL7 733 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT13Q86X67 352 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CDC20BQ86Y33 519 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RILPQ96NA2 401 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM14Q9GZV8 571 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 MPDZO75970 2070 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087X1B8 175 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 ACSL3O95573 720 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 C2P06681 752 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 KLK2P20151 261 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-216ENST00000617451 NEK2P51955 445 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms