RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 P2RX1P51575 399 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SFRP5Q5T4F7 317 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF75AQ96N20 296 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MTFR1LQ9H019 292 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB9BQ9NP90 201 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SCO2O43819 266 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 C8AP07357 584 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SELPP16109 830 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IL17AQ16552 155 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IGSF9Q9P2J2 1179 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5H15A6NDH6 313 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5H14A6NHG9 310 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5H1A6NKK0 313 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CSTAP01040 98 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TFP02787 698 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 AOC1P19801 751 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CLCN2P51788 898 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GBX1Q14549 363 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC16A10Q8TF71 515 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ACBD6Q9BR61 282 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PADI3Q9ULW8 664 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM233B4DJY2 109 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 BTBD2Q9BX70 525 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 STUB1Q9UNE7 303 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GDI1P31150 447 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 NDUFA6P56556 154 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CDONQ4KMG0 1287 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP6Q5VW22 663 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP4Q96P64 663 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLIT1O75093 1534 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SGPP2Q8IWX5 399 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR137CQ8N3F9 429 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 BIRC7Q96CA5 298 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SDHAF2Q9NX18 166 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ANGPTL7O43827 346 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PRMT2P55345 433 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 BEST4Q8NFU0 473 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IL21RQ9HBE5 538 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GFOD1Q9NXC2 390 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ARPC5O15511 151 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PP18 115 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MEIS2O14770 477 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 UNC119BA6NIH7 251 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CD9P21926 228 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 POU4F2Q12837 409 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TPRA1Q86W33 373 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 OR51B6Q9H340 312 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 KNL1Q8NG31 2342 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PRU2 124 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CLIC3O95833 236 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 G6PDP11413 515 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNB4P30926 498 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 COQ10AQ96MF6 247 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 MCHR1Q99705 422 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL21Q9UJP4 597 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CRYZL1O95825 349 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 UQCRC2P22695 453 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTBP60709 375 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTG1P63261 375 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PRRT3Q5FWE3 981 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TLDC1Q6P9B6 456 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCKQ8N0W5 287 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 SULT1C2O00338 296 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 HLA-DQB2P05538 268 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ACY1Q03154 408 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 C3orf49Q96BT1 292 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM225BP0DP42 221 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms