RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602414.5

SNHG8-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 8, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG8, Length 672 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG8-201ENST00000602414 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 A8MXE2 369 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 HRKO00198 91 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 LRATO95237 230 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CHMP24386 653 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 IRF8Q02556 426 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SLAMF1Q13291 335 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 GPR180Q86V85 440 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SNX31Q8N9S9 440 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 GPR75O95800 540 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 MC3RP41968 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CASP3P42574 277 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FNTAP49354 379 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ARFIP1P53367 373 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 NAGLUP54802 743 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FBXW4P57775 412 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TNFRSF17Q02223 184 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FOXF2Q12947 444 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 EIPR1Q53HC9 387 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PDIK1LQ8N165 341 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 GSX2Q9BZM3 304 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 DERL2Q9GZP9 239 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 RBSNQ9H1K0 784 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.48□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 RTTNQ86VV8 2226 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TRIM64BA6NI03 449 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 MSTNO14793 375 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TAPBPO15533 448 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PRAMEF4O60810 478 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CRLF1O75462 422 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CD22P20273 847 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TAS2R39P59534 338 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CHIT1Q13231 466 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 E2F2Q14209 437 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SETDB1Q15047 1291 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PPP1R7Q15435 360 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 MSS51Q4VC12 460 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 DCST1Q5T197 706 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 MED27Q6P2C8 311 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 GPSM1Q86YR5 675 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 LAS2Q8IYD9 372 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 RGMAQ96B86 450 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 LRRC39Q96DD0 335 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PERPQ96FX8 193 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 PBKQ96KB5 322 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 H0Y3Z8 333 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TMCC2O75069 709 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 BANF1O75531 89 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 TGFB1P01137 390 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 CRHP06850 196 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG8-201ENST00000602414 SLC35E2P0CK97 266 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms