RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TRABD2AQ86V40 505 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 PRKXP51817 358 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NAA40Q86UY6 237 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 COMMD1Q8N668 190 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.03□□□□□ -1.44
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