RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 ZNF681Q96N22 645 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 BBS4Q96RK4 519 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 REEP4Q9H6H4 257 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PNPOQ9NVS9 261 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MYOTQ9UBF9 498 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CFL2Q9Y281 166 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TBX19O60806 448 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ITGA10O75578 1167 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 C1QL1O75973 258 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 WDPCPO95876 746 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 IGKV3-11P04433 115 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 KITP10721 976 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PRPS1L1P21108 318 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TACR1P25103 407 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 NTSP30990 170 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 HPCAL1P37235 193 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CYB561P49447 251 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TNFSF10P50591 281 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MLF1P58340 268 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 FUT7Q11130 342 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CEBPEQ15744 281 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 NADK2Q4G0N4 442 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 IL23RQ5VWK5 629 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SLC6A19Q695T7 634 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF605Q86T29 641 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MMP21Q8N119 569 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 BEST3Q8N1M1 668 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 LIX1Q8N485 282 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TMEM156Q8N614 296 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SLC15A4Q8N697 577 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 NUBPLQ8TB37 319 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF675Q8TD23 568 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PPCDCQ96CD2 204 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MAGEB18Q96M61 343 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 C7orf26Q96N11 449 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TSSK3Q96PN8 268 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MFRPQ9BY79 579 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 NUF2Q9BZD4 464 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ASIC5Q9NY37 505 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TTLL8A6PVC2 850 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 GABRR3A8MPY1 467 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 OR2J2O76002 312 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TGDSO95455 350 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CD46P15529 392 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 LBPP18428 481 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CD96P40200 585 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CD97P48960 835 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 HLCSP50747 726 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SSR4P51571 173 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SLC37A1P57057 533 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 MPEG1Q2M385 716 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 OPN5Q6U736 354 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 AMER2Q8N7J2 671 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 ASB15Q8WXK1 588 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TP53INP1Q96A56 240 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-224ENST00000551155 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms