RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RASSF1Q9NS23 344 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 EDARQ9UNE0 448 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ASB4Q9Y574 426 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.14□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A087X1B8 175 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0A6YYD5 115 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC14BA6NHZ5 514 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 AHRRA9YTQ3 701 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 H0YIV9 168 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SYT5O00445 386 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ACSL3O95573 720 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 AIFM1O95831 613 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 IL2RAP01589 272 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 C1QAP02745 245 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC35E2P0CK97 266 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 MTHFD2P13995 350 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT15P19012 456 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 DNASE1P24855 282 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PIK3R1P27986 724 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGEA4P43358 317 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ASCL1P50553 236 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PCDH1Q08174 1060 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF3C1Q12789 2109 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2H2Q13888 395 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SETDB1Q15047 1291 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 FLYWCH1Q4VC44 716 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 KLC3Q6P597 504 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PRR22Q8IZ63 422 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 NAXEQ8NCW5 288 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RILPQ96NA2 401 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GNRHR2Q96P88 292 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CDK15Q96Q40 435 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIB1Q96RU8 372 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TIMP4Q99727 224 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX15Q9NRS6 342 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF358Q9NW07 568 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1W2PS29 197 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 A6NNC1 897 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 GNB5O14775 395 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 PGRMC2O15173 223 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX4O95219 450 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 EPPINO95925 133 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CLPSP04118 112 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 C2P06681 752 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 KLK2P20151 261 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 NT5EP21589 574 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TACR1P25103 407 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 BSGP35613 385 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ARFIP1P53367 373 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CAV1Q03135 178 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CUL3Q13618 768 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ACAP2Q15057 778 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.634e-9■■□□□ 12.9
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CDC20BQ86Y33 519 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 LACC1Q8IV20 430 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 OR10A5Q9H207 317 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms