RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517003.1

RN7SKP2-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP2, Length 319 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP2-201ENST00000517003 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ACVR2AP27037 513 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CERS1P27544 350 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CAPZBP47756 277 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 GABRA4P48169 554 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ALDH9A1P49189 494 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DAPP51397 102 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 IST1P53990 364 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 LIM2P55344 173 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NXPH1P58417 271 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ESRRGP62508 458 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 COX10Q12887 443 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DGCR6Q14129 220 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NDUFA9Q16795 377 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZBED5Q49AG3 693 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 COLEC12Q5KU26 742 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 FHL5Q5TD97 284 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 RNF220Q5VTB9 566 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF773Q6PK81 442 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 C11orf74Q86VG3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 KCT2Q8NC54 265 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 GIPC3Q8TF64 312 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC35B4Q969S0 331 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 GIMAP5Q96F15 307 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 TMEM19Q96HH6 336 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SPACA7Q96KW9 195 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 STACQ99469 402 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 APOL4Q9BPW4 351 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PINK1Q9BXM7 581 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 THADAQ6YHU6 1953 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PI4KAP42356 2102 aa7.36□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 HYKKA2RU49 373 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 TLCD2A6NGC4 264 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 K7ESF4 209 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 UBXN7O94888 489 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 GPR75O95800 540 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ADAP00813 363 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SERPIND1P05546 499 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 FESP07332 822 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 THBS1P07996 1170 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SLC35E2P0CK97 266 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CPMP14384 443 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 MATN1P21941 496 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 CBLP22681 906 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PRKAR1BP31321 381 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SOAT1P35610 550 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SOX11P35716 441 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 PIGAP37287 484 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 LSSP48449 732 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 BTN3A2P78410 334 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 MAP4K2Q12851 820 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NPRL3Q12980 569 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 HSPB3Q12988 150 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 TP53BP2Q13625 1128 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 RUNX2Q13950 521 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 DUSP7Q16829 419 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 NADK2Q4G0N4 442 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 TCTE1Q5JU00 501 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.35□□□□□ -1.23
RN7SKP2-201ENST00000517003 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms