RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516217.1

RNU6-1262P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1262, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1262P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 A0A1B0GUH1 482 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TCP10L2B9ZVM9 353 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SULT2B1O00204 365 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLC28A1O00337 649 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MAP2K7O14733 419 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PSMD3O43242 534 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AQP9O43315 295 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIF5CO60282 957 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SDC3O75056 442 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 JRKO75564 520 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CPNE6O95741 557 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 HOXB5P09067 269 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF35P13682 527 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TCF4P15884 667 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SPRR2DP22532 72 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ACP1P24666 158 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 GARSP41250 739 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EFNB2P52799 333 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SP4Q02446 784 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 C2orf54Q08AI8 447 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF415Q09FC8 603 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 GALEQ14376 348 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RABGAP1LQ5R372 815 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ELFN2Q5R3F8 820 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CPTPQ5TA50 214 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TTC22Q5TAA0 569 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RNF220Q5VTB9 566 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 WDR78Q5VTH9 848 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR5M10Q6IEU7 315 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LIN54Q6MZP7 749 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CASP12Q6UXS9 341 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 COX15Q7KZN9 410 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ARMCX2Q7L311 632 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OVCH2Q7RTZ1 564 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ARHGAP24Q8N264 748 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCDC191Q8NCU4 936 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR2T33Q8NG76 320 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR2AP1Q8NGE2 309 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR5W2Q8NH69 310 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RNF139Q8WU17 664 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CHAC2Q8WUX2 184 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 METTL21AQ8WXB1 218 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PIK3R3Q92569 461 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TNFRSF14Q92956 283 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CREB3L1Q96BA8 519 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 BTBD10Q9BSF8 475 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 H2AFJQ9BTM1 129 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TTTY12Q9BZ98 90 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM60Q9H2L4 133 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 XKR8Q9H6D3 395 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TLE6Q9H808 572 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EPB41L5Q9HCM4 733 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MED4Q9NPJ6 270 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NANSQ9NR45 359 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FBXO8Q9NRD0 319 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 STARD5Q9NSY2 213 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TBC1D13Q9NVG8 400 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MLXQ9UH92 298 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DNPEPQ9ULA0 475 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DERAQ9Y315 318 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 WDR45Q9Y484 360 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NCKAP5O14513 1909 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CRB1P82279 1406 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 VWA8A3KMH1 1905 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 A0A1W2PP18 115 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TRABD2BA6NFA1 517 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LEUTXA8MZ59 168 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ATP2A1O14983 1001 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PIP5K1BO14986 540 aa-1.3□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms