RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 PGAM5Q96HS1 289 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR10C1Q96KK4 312 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 FUT8Q9BYC5 575 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 MMP27Q9H306 513 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 DPEP2Q9H4A9 486 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 SEC14L4Q9UDX3 406 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPS6KA6Q9UK32 745 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-904P-201ENST00000516206 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 GJE1A6NN92 205 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADAMDEC1O15204 470 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 RRP8O43159 456 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 SEMG1P04279 462 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSN3P07498 182 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 STAG3L1P0CL83 205 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 HOXA9P31269 272 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 DLSTP36957 453 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 LCP2Q13094 533 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MS4A13Q5J8X5 152 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ACAD10Q6JQN1 1059 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 FUT10Q6P4F1 479 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM154Q6P9G4 183 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 FRA10AC1Q70Z53 315 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PIGCQ92535 297 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 C16orf58Q96GQ5 468 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDCL3Q9H2J4 239 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 NARFLQ9H6Q4 476 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 JMJD4Q9H9V9 463 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADGRL4Q9HBW9 690 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MED17Q9NVC6 651 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CD274Q9NZQ7 290 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ITM2BQ9Y287 266 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYO1GB0I1T2 1018 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF254O75437 659 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 NOL4O94818 638 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR2C1O95371 312 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CLEC3BP05452 202 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC1A3P43003 542 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPM6AP51674 278 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MFAP4P55083 255 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 NOP14P78316 857 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ACSM1Q08AH1 577 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 BECN1Q14457 450 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCTD2Q14681 263 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 NTRK2Q16620 822 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 UNC50Q53HI1 259 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PAGE3Q5JUK9 113 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARSKQ6UWY0 536 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 APOOLQ6UXV4 268 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 C17orf107Q6ZR85 190 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF165Q6ZSG1 346 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 OTOAQ7RTW8 1153 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRSS48Q7RTY5 328 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 TIGD4Q8IY51 512 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MCOLN2Q8IZK6 566 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CAMKVQ8NCB2 501 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF461Q8TAF7 563 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBTD2Q8WUN7 234 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZUFSPQ96AP4 578 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 C9orf85Q96MD7 179 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSMD1Q99460 953 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 APOL6Q9BWW8 343 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 WWP1Q9H0M0 922 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 RETNQ9HD89 108 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 NGBQ9NPG2 151 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 GGA3Q9NZ52 723 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSMB11A5LHX3 300 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM149AA5PLN7 773 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 A8MUU9 505 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDRT15L2A8MXV6 281 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF732B4DXR9 585 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PGRMC2O15173 223 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBL1XO60907 577 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms