RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 KCNAB3O43448 404 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 FGF17O60258 216 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 GPRIN2O60269 458 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PRAMEF4O60810 478 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 GSTM2P28161 218 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PTPN6P29350 595 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 UGT2B10P36537 528 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CPOXP36551 454 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CD79BP40259 229 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 CASP3P42574 277 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 HNMTP50135 292 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 MTTPP55157 894 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SERTAD2Q14140 314 aa10.15□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 RCN2Q14257 317 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.15□□□□□ -0.78
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RNF4-218ENST00000513284 ZNF793Q6ZN11 406 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 BTLAQ7Z6A9 289 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 LRRC39Q96DD0 335 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 MS4A14Q96JA4 679 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 MED18Q9BUE0 208 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 WWOXQ9NZC7 414 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 VWA7Q9Y334 891 aa10.15□□□□□ -0.78
RNF4-218ENST00000513284 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.15□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 FRG2CA6NGY1 282 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 WASHC1A8K0Z3 465 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 SNX4O95219 450 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ACTL6AO96019 429 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 AHSGP02765 367 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 THBS1P07996 1170 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 STARP49675 285 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 SRYQ05066 204 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 VEZF1Q14119 521 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 TBCELQ5QJ74 424 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 DESI1Q6ICB0 168 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 SBSNQ6UWP8 590 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD7Q92527 254 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 FBXL20Q96IG2 436 aa10.14□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 F2RL3Q96RI0 385 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 EGFL8Q99944 293 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.14□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 RTCAO00442 366 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 GNB5O14775 395 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ZSCAN12O43309 604 aa10.13□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 GDF5P43026 501 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 SLC12A2P55011 1212 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 SLC37A1P57057 533 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 CDKL1Q00532 357 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 TGM3Q08188 693 aa10.13□□□□□ -0.79
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RNF4-218ENST00000513284 MORF4L2Q15014 288 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 TOMM20Q15388 145 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 PACS2Q86VP3 889 aa10.13□□□□□ -0.79
RNF4-218ENST00000513284 KRT78Q8N1N4 520 aa10.13□□□□□ -0.79
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