RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 DUSP8Q13202 625 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CUL3Q13618 768 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 SLMAPQ14BN4 828 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 DOK4Q8TEW6 326 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 TP53INP1Q96A56 240 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF597Q96LX8 424 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 PROK2Q9HC23 129 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 SNX15Q9NRS6 342 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 RASSF1Q9NS23 344 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ASB4Q9Y574 426 aa11.05□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 A0A1W2PR48 441 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC189A1A4V9 331 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 H0YIV9 168 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 FAM155BO75949 473 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ACSL3O95573 720 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 NR2F6P10588 404 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 GFAPP14136 432 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 PIK3R1P27986 724 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 TIMP3P35625 211 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 MASP1P48740 699 aa11.04□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 ASCL1P50553 236 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 DGKQP52824 942 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 NRG3P56975 720 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CAV1Q03135 178 aa11.04□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 CCDC25Q86WR0 208 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 KIF18BQ86Y91 864 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 LACC1Q8IV20 430 aa11.04□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 TIMP4Q99727 224 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF358Q9NW07 568 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.04□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 FREM3P0C091 2139 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087X1B8 175 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 A6NNC1 897 aa11.03□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 UGDHO60701 494 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CDH16O75309 829 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 LRATO95237 230 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 KRT15P19012 456 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 KLK2P20151 261 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 MAGEA4P43358 317 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 PIK3CGP48736 1102 aa11.03□□□□□ -0.64
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CNOT4-211ENST00000498534 PLTPP55058 493 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 GPX6P59796 221 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 NAB1Q13506 487 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 SETDB1Q15047 1291 aa11.03□□□□□ -0.64
CNOT4-211ENST00000498534 RPS6KA2Q15349 733 aa11.03□□□□□ -0.64
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