RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 HAS2Q92819 552 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 C1orf50Q9BV19 199 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 NUF2Q9BZD4 464 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 EPN3Q9H201 632 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.04□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 DYTNA2CJ06 578 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 OR5H15A6NDH6 313 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 WWP2O00308 870 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 KLF11O14901 512 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 AKAP10O43572 662 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 DYRK3O43781 588 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 SLC28A2O43868 658 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ITGA10O75578 1167 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ATP1B1P05026 303 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 KITP10721 976 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 BCKDHAP12694 445 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 S1PR1P21453 382 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CD96P40200 585 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CASRP41180 1078 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TNFSF10P50591 281 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MLLT10P55197 1068 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 RNF4P78317 190 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MGAT2Q10469 447 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 DUSP8Q13202 625 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TUBA3CQ13748 450 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CEBPEQ15744 281 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ZNF385BQ569K4 471 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 IL23RQ5VWK5 629 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 HSDL2Q6YN16 418 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 LGI4Q8N135 537 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 LIX1Q8N485 282 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 NUDT8Q8WV74 236 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 FBXL20Q96IG2 436 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ART5Q96L15 291 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CCT7Q99832 543 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 RNF32Q9H0A6 362 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 EHD3Q9NZN3 535 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 PSME2Q9UL46 239 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 CACNA1GO43497 2377 aa8.03□□□□□ -1.12
PKP4-216ENST00000495123 BSNQ9UPA5 3926 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 SDHDO14521 159 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 OR2J2O76002 312 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 NEURL1O76050 574 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 CBX7O95931 251 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 G6PDP11413 515 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 PCSK2P16519 638 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 MMP16P51512 607 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 SLC37A1P57057 533 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 FUT7Q11130 342 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 MAP4K2Q12851 820 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 PDE7AQ13946 482 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 PTGR1Q14914 329 aa8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PKP4-216ENST00000495123 TLR1Q15399 786 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms