RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	SAXO2	Q658L1	398 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCH	Q86VS3	1027 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD46	Q86W74	232 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PAQR7	Q86WK9	346 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CBR4	Q8N4T8	237 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5C	Q8TCD5	201 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FIG4	Q92562	907 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PPCDC	Q96CD2	204 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NEURL3	Q96EH8	262 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CIB1	Q99828	191 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPK	Q9BS16	269 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	AICDA	Q9GZX7	198 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	UCK1	Q9HA47	277 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FZD3	Q9NPG1	666 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CD93	Q9NPY3	652 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	POT1	Q9NUX5	634 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPC4	97 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PRB8	838 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DPPA5	A6NC42	116 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MVJ9	347 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SCD	O00767	359 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DVL2	O14641	736 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1F1	O43749	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NOBOX	O60393	691 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GUCY1B2	O75343	617 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT75	O95678	551 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EML2	O95834	649 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf47	O95873	294 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINA1	P01009	418 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ASGR2	P07307	311 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	UQCRC2	P22695	453 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CFP	P27918	469 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMB5	P28074	263 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CD6	P30203	668 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MC3R	P41968	323 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RXRG	P48443	463 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LSS	P48449	732 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK12	P53778	367 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ARSF	P54793	590 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGA1	P56199	1179 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN2	P57739	230 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00310	P59036	64 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBA4A	P68366	448 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MYBPC1	Q00872	1141 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MERTK	Q12866	999 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EPS8	Q12929	822 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DAG1	Q14118	895 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NRF1	Q16656	503 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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