RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF583Q96ND8 569 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 EHD3Q9NZN3 535 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 TBX19O60806 448 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SOX18P35713 384 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 TRPC1P48995 793 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 PRKAG1P54619 331 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SLC13A2Q13183 592 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZFP90Q8TF47 636 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CDC6Q99741 560 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ALG2Q9H553 416 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CTSFQ9UBX1 484 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.98■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 FAM149AA5PLN7 773 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 TNFAIP8O95379 198 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ME2P23368 584 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 GPC1P35052 558 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 VPS4AQ9UN37 437 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GX78 115 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 H0YJX3 145 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 NPPAP01160 153 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 GSTM5P46439 218 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MAPK10P53779 464 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ADRM1Q16186 407 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 BORAQ6PGQ7 559 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 RNF130Q86XS8 419 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MAL2Q969L2 176 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 LRGUKQ96M69 825 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.97■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 DSCR3O14972 297 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CLPTM1O96005 669 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 TFAP2AP05549 437 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 PCSK2P16519 638 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 NTSP30990 170 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 MC3RP41968 323 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ISXQ2M1V0 245 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SATL1Q86VE3 508 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO30Q8TB52 745 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 SPACA6W5XKT8 324 aa16.96■□□□□ 0.31
ATG4B-217ENST00000475693 H0YIG0 161 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CSO75390 466 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CT62P0C5K7 136 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ETFAP13804 333 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CPMP14384 443 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MVDP53602 400 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FLOT2Q14254 428 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 HES3Q5TGS1 186 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 COX15Q7KZN9 410 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GALNT10Q86SR1 603 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PHF12Q96QT6 1004 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 PSME2Q9UL46 239 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.96■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 HRKO00198 91 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 ACOT8O14734 319 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 GPR75O95800 540 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 MT-CO3P00414 261 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FHP07954 510 aa16.95■□□□□ 0.3
ATG4B-217ENST00000475693 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms