RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GRK3P35626 688 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RXRGP48443 463 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RAD23AP54725 363 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CASP9P55211 416 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LIM2P55344 173 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 STARD6P59095 220 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35A2P78381 396 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF17Q02223 184 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MGAT2Q10469 447 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLAMF1Q13291 335 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CDK5R2Q13319 367 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PMS2P3Q13401 168 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A5Q14940 896 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PLCL1Q15111 1095 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GPR19Q15760 415 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MEP1AQ16819 746 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C18orf63Q68DL7 685 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 USP53Q70EK8 1073 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ASPGQ86U10 573 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 IQCHQ86VS3 1027 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SHISA5Q8N114 240 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A8Q8N695 610 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD1Q8N878 549 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 APH1BQ8WW43 257 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FGF11Q92914 225 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-CQ95604 372 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MUL1Q969V5 352 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP10Q96AY3 582 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN23Q96B33 292 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MOAP1Q96BY2 351 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PIP5K1AQ99755 562 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC61Q9BV99 259 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 REEP1Q9H902 201 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 UCK1Q9HA47 277 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LYRM4Q9HD34 91 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RLIMQ9NVW2 624 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 POMT2Q9UKY4 750 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 U3KQV3 271 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FER1L5A0AVI2 2057 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YY10 115 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 LILRA5A6NI73 299 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GLOD5A6NK44 160 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 METTL12A8MUP2 240 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 H0YGG7 62 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 J3KTA2 159 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CYR61O00622 381 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH17O14917 1159 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HS6ST1O60243 411 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA12O60330 932 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 UGT2B11O75310 529 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GUCY1B2O75343 617 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 E2F6O75461 281 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLITRK5O94991 958 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TNFP01375 233 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA14P01570 189 aa5.31□□□□□ -1.56
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