RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 PRODH2Q9UF12 536 aa8.91□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.91□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.91□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SPTA1P02549 2419 aa8.91□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.91□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ITM2AO43736 263 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 C1QL1O75973 258 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 OR2J2O76002 312 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PRPS2P11908 318 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PRPH2P23942 346 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SOX11P35716 441 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 KRT20P35900 424 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HLCSP50747 726 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 GPR143P51810 404 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PPP2R2AP63151 447 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 BST1Q10588 318 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TUBA3CQ13748 450 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MPP2Q14168 576 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 IL23RQ5VWK5 629 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SPINK14Q6IE38 97 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SZRD1Q7Z422 152 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 LIX1Q8N485 282 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 BCORP1Q8N888 145 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 OR8K3Q8NH51 312 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 UCN3Q969E3 161 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MAGED4Q96JG8 741 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TRIM4Q9C037 500 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 EPN3Q9H201 632 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 OR10A5Q9H207 317 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 REEP4Q9H6H4 257 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ATMQ13315 3056 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ATRXP46100 2492 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 TP53I11O14683 189 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 CFLARO15519 480 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A12O75746 678 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 DDAH2O95865 285 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 P04436 131 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SP1P08047 785 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 BCKDHAP12694 445 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 LBPP18428 481 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SSTR4P31391 388 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 CD97P48960 835 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 KCNC4Q03721 635 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 PGS1Q32NB8 556 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 CPTPQ5TA50 214 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZSR9 355 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 MMP21Q8N119 569 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 SLC15A4Q8N697 577 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 NATD1Q8N6N6 113 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 FAM13CQ8NE31 585 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 NUBPLQ8TB37 319 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ZNF721Q8TF20 911 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 ZBTB18Q99592 522 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-208ENST00000462335 C1orf50Q9BV19 199 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms