RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 CEBPEQ15744 281 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 MMP21Q8N119 569 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM80Q96HE8 168 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PRRC1Q96M27 445 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SP140LQ9H930 580 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 IFT52Q9Y366 437 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ASB4Q9Y574 426 aa14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PP55 124 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DUXAA6NLW8 204 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TOR1BO14657 336 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 LGI1O95970 557 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DNTTP04053 509 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 OR12D1P0DN82 309 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 BMP4P12644 408 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 GADD45AP24522 165 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 LIMK1P53667 647 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SLAMF1Q13291 335 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 MAPK11Q15759 364 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SYT16Q17RD7 645 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2L3Q8NG85 312 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 APOOQ9BUR5 198 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 MND1Q9BWT6 205 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 OR1A2Q9Y585 309 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ALPK3Q96L96 1907 aa14.84□□□□□ -0.03
SUCLG2-202ENST00000460567 CKAP5Q14008 2032 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 AXIN1O15169 862 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SNX4O95219 450 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 MED26O95402 600 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SERPIND1P05546 499 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 BCL6P41182 706 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 RPE65Q16518 533 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 DEF8Q6ZN54 512 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 RAB8BQ92930 207 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 MGLLQ99685 303 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 GABRG3Q99928 467 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 TEX12Q9BXU0 123 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.83□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PQU0 124 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 URADA6NGE7 173 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 AGAP5A6NIR3 686 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 H3BN98 237 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 SCG5P05408 212 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 POU2F1P14859 743 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 NTSR1P30989 418 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ETV6P41212 452 aa14.82□□□□□ -0.04
SUCLG2-202ENST00000460567 GSSP48637 474 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms