RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OOSP2	Q86WS3	158 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	S1PR5	Q9H228	398 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MMP27	Q9H306	513 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LYRM4	Q9HD34	91 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RASSF1	Q9NS23	344 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	POT1	Q9NUX5	634 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	GIN1	Q9NXP7	522 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	BRCA2	P51587	3418 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0G2JNG1	304 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf74	A8MZ97	194 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR4	O00206	839 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	HAT1	O14929	419 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	AXIN1	O15169	862 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PROM1	O43490	865 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR10H3	O60404	316 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LGI1	O95970	557 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TNF	P01375	233 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ALOX5	P09917	674 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CD36	P16671	472 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SOX6	P35712	828 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ENTPD1	P49961	510 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	BLK	P51451	505 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CCR5	P51681	352 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	XK	P51811	444 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF17	Q02223	184 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ST3GAL3	Q11203	375 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KIR2DS5	Q14953	304 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP7	Q16829	419 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CACUL1	Q86Y37	369 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52J3	Q8NH60	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCG4	Q9H172	646 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	NTM	Q9P121	344 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF15	Q9UIH9	416 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQF6	199 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-222	ENST00000459758	AP3D1	O14617	1153 aa		10.86	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms