RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448310.1

CBX4-202, Transcript of chromobox 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CBX4, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-202ENST00000448310 SERPINB8P50452 374 aa25.99■■□□□ 1.75
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CBX4-202ENST00000448310 DIO2Q92813 273 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 PHF21BQ96EK2 531 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 CXorf21Q9HAI6 301 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 ACKR4Q9NPB9 350 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 NINJ2Q9NZG7 142 aa25.97■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.97■■□□□ 1.75
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CBX4-202ENST00000448310 SEM1Q6ZVN7 128 aa25.96■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 ULK2Q8IYT8 1036 aa25.96■■□□□ 1.75
CBX4-202ENST00000448310 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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CBX4-202ENST00000448310 QPCTLQ9NXS2 382 aa25.96■■□□□ 1.75
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CBX4-202ENST00000448310 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa25.95■■□□□ 1.74
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CBX4-202ENST00000448310 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
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CBX4-202ENST00000448310 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa25.94■■□□□ 1.74
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CBX4-202ENST00000448310 TMEM198Q66K66 360 aa25.94■■□□□ 1.74
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CBX4-202ENST00000448310 TP53INP1Q96A56 240 aa25.93■■□□□ 1.74
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CBX4-202ENST00000448310 FRG2BQ96QU4 278 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 OR10A5Q9H207 317 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 SLC24A3Q9HC58 644 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 ZBTB26Q9HCK0 441 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 XPR1Q9UBH6 696 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 PCTPQ9UKL6 214 aa25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.92■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa25.92■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 TRAPPC6AO75865 159 aa25.92■■□□□ 1.74
CBX4-202ENST00000448310 NT5EP21589 574 aa25.92■■□□□ 1.74
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