RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF234Q14588 700 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRRQ15256 657 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SGO1Q5FBB7 561 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SCML1Q9UN30 329 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.99■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SHISA7A6NL88 538 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 WASH3PC4AMC7 463 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SUV39H1O43463 412 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 BNIP3LO60238 219 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 C1QCP02747 245 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CKMT1AP12532 417 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LHCGRP22888 699 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MADCAM1Q13477 382 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 VEZF1Q14119 521 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SOSTQ9BQB4 213 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CD244Q9BZW8 370 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 K7EQS6 105 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 WWP2O00308 870 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TPST2O60704 377 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CTSLP07711 333 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 HLA-EP13747 358 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK8P45983 427 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CLCNKAP51800 687 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NFE2L1Q14494 772 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MICAQ29983 383 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 BICRALQ6AI39 1079 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TTLQ8NG68 377 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 AP3S1Q92572 193 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL15Q96M94 604 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CKAP5Q14008 2032 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 A8MVJ9 347 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CHP2O43745 196 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ABRQ12979 859 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 BTN1A1Q13410 526 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL22Q53GT1 634 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 FBXW5Q969U6 566 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MARC2Q969Z3 335 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PHF21AQ96BD5 680 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PPT2Q9UMR5 302 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 F5P12259 2224 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SOCS5O75159 536 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 APODP05090 189 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 SDC2P34741 201 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 NNMTP40261 264 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CBX5P45973 191 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 HSPA7P48741 367 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 RAB14P61106 215 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 BTG1P62324 171 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 PPP3R1P63098 170 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 BCL2L1Q07817 233 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-205ENST00000436404 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms