RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XPR1Q9UBH6 696 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PJA2O43164 708 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP1A3P13637 1013 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPOCK1Q08629 439 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDK5R2Q13319 367 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADCK2Q7Z695 626 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP6Q96JE9 813 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYCE3A1L190 88 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT87PA6NCN2 255 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK1O00180 336 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNB5O14775 395 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR37O15354 613 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPOP01588 193 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERGP11308 486 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABATP80404 500 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPA1Q15181 289 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LCTLQ6UWM7 567 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CES3Q6UWW8 571 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF677Q86XU0 584 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TC2NQ8N9U0 490 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMPDL3AQ92484 453 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIX2Q9NPC8 291 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUP50Q9UKX7 468 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARL5AQ9Y689 179 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 E9PQ18 207 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TP53I11O14683 189 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGS14O43566 566 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf105O95561 183 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFTPBP07988 381 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANPEPP15144 967 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FUT4P22083 530 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMA2P25787 234 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASPGQ86U10 573 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO17Q96EF6 278 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAC3Q9UHF0 121 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NENFQ9UMX5 172 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCGR2AP12318 317 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALOX12P18054 663 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTAFRP25105 342 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PON1P27169 355 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BDKRB1P46663 353 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTBP2P56545 445 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMO1Q01740 532 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB134Q4QY38 66 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PINK1Q9BXM7 581 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCM8Q9UJA3 840 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCF4P15884 667 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GATA3P23771 443 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms