RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 CEP250Q9BV73 2442 aa8.21□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CACNA1HO95180 2353 aa8.21□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CIB4A0PJX0 185 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SMLR1H3BR10 107 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AKR7A2O43488 359 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF254O75437 659 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLITRK5O94991 958 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF30P17039 623 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AGXTP21549 392 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KIR3DL1P43629 444 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MLLT10P55197 1068 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TAS2R50P59544 299 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CLCA4Q14CN2 919 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 IRF4Q15306 451 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TIGD6Q17RP2 521 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM209BQ5JX69 171 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DDI2Q5TDH0 399 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RAB8BQ92930 207 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TCEAL3Q969E4 200 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FATE1Q969F0 183 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF175Q9Y473 711 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TOR1AO14656 332 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ACOX3O15254 700 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TOXO94900 526 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNK2O95069 426 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C8GP07360 202 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF3P17036 446 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CD22P20273 847 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ATP6V1E1P36543 226 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CTBSQ01459 385 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DUSP7Q16829 419 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF613Q6PF04 617 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT74Q7RTS7 529 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR149Q86SP6 731 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 Q96MT0 163 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 OR4K3Q96R72 315 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCG4Q9H172 646 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PCDH7O60245 1069 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DHFRP00374 187 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ITGA2P17301 1181 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SDC1P18827 310 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HTR3AP46098 478 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HAAOP46952 286 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HNMTP50135 292 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PFN3P60673 137 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 B2MP61769 119 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNAB2Q13303 367 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AQP6Q13520 282 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C17orf64Q86WR6 236 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC34A3Q8N130 599 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KCT2Q8NC54 265 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 STARD5Q9NSY2 213 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RHCGQ9UBD6 479 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RNF6Q9Y252 685 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PCM1Q15154 2024 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC28A1O00337 649 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC30A4O14863 429 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PVRP15151 417 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DPPA4Q7L190 304 aa8.2□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms