RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF4P78317 190 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF32Q9H0A6 362 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.144e-6■□□□□ 10.3
UBE2E3-202ENST00000410062 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 OR5H15A6NDH6 313 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 KLF11O14901 512 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 AKAP10O43572 662 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SSTR4P31391 388 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 CASRP41180 1078 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TNFSF10P50591 281 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBA3CQ13748 450 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LTB4RQ15722 352 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 LIX1Q8N485 282 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 EPN3Q9H201 632 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC28A2O43868 658 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ITGA10O75578 1167 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CLPSP04118 112 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MAPK1P28482 360 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CD96P40200 585 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TLR1Q15399 786 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 IL23RQ5VWK5 629 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8K3Q8NH51 312 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MYOTQ9UBF9 498 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 WWP2O00308 870 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 FCHO1O14526 889 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC37A1P57057 533 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MGAT2Q10469 447 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TTLL8A6PVC2 850 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2J2O76002 312 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SOX18P35713 384 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MLLT10P55197 1068 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 FUT7Q11130 342 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CEBPEQ15744 281 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF605Q86T29 641 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR5L2Q8NGL0 311 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 BBS4Q96RK4 519 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 REEP4Q9H6H4 257 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 S1PR1P21453 382 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ASMTP46597 345 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP4K2Q12851 820 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PTGR1Q14914 329 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SPINK14Q6IE38 97 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR10A5Q9H207 317 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 HDAC3O15379 428 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PCSK2P16519 638 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 EMX2Q04743 252 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1C1Q15619 314 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 KAT2AQ92830 837 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GAL3ST4Q96RP7 486 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PRPS2P11908 318 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MPIP34949 423 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SSR4P51571 173 aa22.1■■□□□ 1.13
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