RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 H0YGG7 62 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PGRMC2O15173 223 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AQP9O43315 295 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PIAS2O75928 621 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AIFM1O95831 613 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 SERPIND1P05546 499 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 GIMD1P0DJR0 217 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ETFAP13804 333 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CERS1P27544 350 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 BTN3A2P78410 334 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TNFRSF17Q02223 184 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 RUNX2Q13950 521 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NR1D2Q14995 579 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 MAPK11Q15759 364 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL35Q6PF15 583 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 SVOPLQ8N434 492 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 C7orf34Q96L11 122 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 Q9H521 79 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 THEGQ9P2T0 379 aa5.67□□□□□ -1.5
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C6orf48-208ENST00000395788 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.67□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.66□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0J9YVX5 310 aa5.66□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.66□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.66□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.66□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A6NHS1 94 aa5.66□□□□□ -1.5
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