RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 H3BN98 237 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 M0R082 166 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 AGRPO00253 132 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CCNB2O95067 398 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 APOL3O95236 402 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 GADD45AP24522 165 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 UTS2BQ765I0 119 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 LGALS12Q96DT0 336 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 YIPF6Q96EC8 236 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PDXPQ96GD0 296 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ICKQ9UPZ9 632 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 IFT52Q9Y366 437 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 NR2F1P10589 423 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TNNI3P19429 210 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MAGP20916 626 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CHMP24386 653 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 REEP5Q00765 189 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CARTPTQ16568 116 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TMEM196Q5HYL7 178 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TMEM107Q6UX40 140 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ZNF605Q86T29 641 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 STX19Q8N4C7 294 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 KAT2AQ92830 837 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RAB7BQ96AH8 199 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 OR5M11Q96RB7 305 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ZNF347Q96SE7 839 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PITX2Q99697 317 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RHBGQ9H310 441 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 GDE1Q9NZC3 331 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 A0A1W2PR48 441 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 NOTOA8MTQ0 251 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MFN2O95140 757 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RPA4Q13156 261 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 LRRC32Q14392 662 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SAXO2Q658L1 398 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ADCK1Q86TW2 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 BBS4Q96RK4 519 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 OR51E2Q9H255 320 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RERGLQ9H628 205 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CLDN25C9JDP6 229 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 BTN3A3O00478 584 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 GABARAPO95166 117 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CKMT1AP12532 417 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TRIM23P36406 574 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TGFBR2P37173 567 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ERVK-21P61565 698 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 IFITM2Q01629 132 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RBBP4Q09028 425 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 LTB4RQ15722 352 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 INAVAQ3KP66 663 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 FLCNQ8NFG4 579 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 NEURL3Q96EH8 262 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 OR2A25A4D2G3 310 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 GUCY1B2O75343 617 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 RAB28P51157 221 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PATE1Q8WXA2 126 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC13-202ENST00000366662 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms