RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 DPYSL4O14531 572 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MDM4O15151 490 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 KLF4O43474 513 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GMFGO60234 142 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HPGDSO60760 199 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MTX2O75431 263 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ALPPP05187 535 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ARSBP15848 533 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TGM2P21980 687 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ME2P23368 584 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 EPHA3P29320 983 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CA5AP35218 305 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GPR15P49685 360 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RGS6P49758 472 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CCR6P51684 374 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 EPHB3P54753 998 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RAB2AP61019 212 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMED2Q15363 201 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SNAPC1Q16533 368 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF773Q6PK81 442 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C16orf89Q6UX73 402 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MISPQ8IVT2 679 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LILRA2Q8N149 483 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GPR137CQ8N3F9 429 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM104Q8NE00 496 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CORO2AQ92828 525 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAF2Q96CS3 445 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MED8Q96G25 268 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 KCNK16Q96T55 309 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ADAM2Q99965 735 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF670Q9BS34 389 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C3orf18Q9UK00 162 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 POFUT2Q9Y2G5 429 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 U3KQV3 271 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LRRN3E7EW58 273 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 OIP5O43482 229 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 KRT33AO76009 404 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ITGAMP11215 1152 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 AOC1P19801 751 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CYP2F1P24903 491 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TEAD1P28347 426 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MATKP42679 507 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HTR5AP47898 357 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 UBE2G2P60604 165 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PKIAP61925 76 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NHLH1Q02575 133 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MERTKQ12866 999 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 BIKQ13323 160 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 IL18R1Q13478 541 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CTF1Q16619 201 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 AVPI1Q5T686 147 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SYVN1Q86TM6 617 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB106AQ8N104 65 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM199Q8N511 208 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ECHDC3Q96DC8 303 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PEX11GQ96HA9 241 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA13Q96N96 652 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MGME1Q9BQP7 344 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ALG2Q9H553 416 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 REEP4Q9H6H4 257 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ARMCX1Q9P291 453 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF225Q9UK10 706 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms