RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309241.9

PPARGC1B-201, Transcript of PPARG coactivator 1 beta, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARGC1B, Length 10,568 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1B-201ENST00000309241 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 POM121CA8CG34 1229 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 VEGFDO43915 354 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 UBBP0CG47 229 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 MAOBP27338 520 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PTPN6P29350 595 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 OGDHQ02218 1023 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 EMX2Q04743 252 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ANKRD46Q86W74 232 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PDE7BQ9NP56 450 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SYPP08247 313 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 HTR1EP28566 365 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GLP1RP43220 463 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CHIT1Q13231 466 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CDNFQ49AH0 187 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 63.7
PPARGC1B-201ENST00000309241 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ST8SIA4Q92187 359 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 KCNC2Q96PR1 638 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 OR10A4Q9H209 315 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GAREM1Q9H706 876 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GNG8Q9UK08 70 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 DAPL1A0PJW8 107 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 MAFKO60675 156 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PNPP00491 289 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SLC2A5P22732 501 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 POC1BQ8TC44 478 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 KLHL15Q96M94 604 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RNF32Q9H0A6 362 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 IL37Q9NZH6 218 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GPR34Q9UPC5 381 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CACNA1DQ01668 2161 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 TISP43B9A030 160 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 FAAHO00519 579 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 FLRT2O43155 660 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GADD45GO95257 159 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CDK1P06493 297 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 GRIN2CQ14957 1233 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 NXPE1Q8N323 547 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 IL31RAQ8NI17 732 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 NENFQ9UMX5 172 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CKMT1AP12532 417 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CRISP1P54107 249 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 IL10RBQ08334 325 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ZNF783Q6ZMS7 281 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ASB6Q9NWX5 421 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 CDHR4A6H8M9 788 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SEC14L2O76054 403 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 NFKB2Q00653 900 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 TPGS2Q68CL5 300 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 NUDT13Q86X67 352 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RFPL3O75679 317 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 MMP12P39900 470 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 ARL14Q8N4G2 192 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 LFNGQ8NES3 379 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 OR2L2Q8NH16 312 aa7.99□□□□□ -1.13
PPARGC1B-201ENST00000309241 RNF128Q8TEB7 428 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms