RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 ITM2AO43736 263 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF695Q8IW36 515 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 HINT2Q9BX68 163 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 COPS3Q9UNS2 423 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TGFB3P10600 412 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SULT2A1Q06520 285 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 OR8U1Q8NH10 309 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 MYOCQ99972 504 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf21Q9H246 121 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 APMAPQ9HDC9 416 aa10.74□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MVM7 634 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 HTR3BO95264 441 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 AMY2AP04746 511 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB5AP20339 215 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM198Q66K66 360 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NANPQ8TBE9 248 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CLEC3BP05452 202 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 AZIN2Q96A70 460 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 XYLBO75191 536 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SOX30O94993 753 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CH25HO95992 272 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NUDT6P53370 316 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB33AQ14088 237 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 STEAP3Q658P3 488 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 C12orf29Q8N999 325 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FNDC9Q8TBE3 224 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 B4GAT1O43505 415 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ADH1CP00326 375 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF17P17021 662 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP2K4P45985 399 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC6A5Q9Y345 797 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TBL1XO60907 577 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 GAAP10253 952 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TNFSF9P41273 254 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FASLGP48023 281 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TGM4P49221 684 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SCAPQ12770 1279 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 LSAMPQ13449 338 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJC19Q96DA6 116 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 DGAT2Q96PD7 388 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR18Q9BV38 432 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 PTPRJQ12913 1337 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 WNT7AO00755 349 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 PHOX2AO14813 284 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 EDNRBP24530 442 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CAPSQ13938 189 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TIFAQ96CG3 184 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF587BE7ETH6 402 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRNA1P02708 482 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 DLDP09622 509 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 EPHX2P34913 555 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 NELL2Q99435 816 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 AGRNO00468 2067 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 D6RAR5 112 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ERBB2P04626 1255 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXA9P31269 272 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB2Q8N680 514 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 GINS3Q9BRX5 216 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa10.73□□□□□ -0.69
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms